MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 93275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	GTTT	2	8	111	118	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004342	CTT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004342	T	7	7	189	195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004342	TA	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004342	AG	4	8	222	229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004342	GGA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212701
7	NC_004342	GAA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212701
8	NC_004342	A	7	7	291	297	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
9	NC_004342	AGAA	2	8	404	411	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
10	NC_004342	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212701
11	NC_004342	AGC	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212701
12	NC_004342	TA	4	8	655	662	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
13	NC_004342	GTAGGA	2	12	672	683	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	24212701
14	NC_004342	A	6	6	723	728	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
15	NC_004342	TATGT	2	10	745	754	20 %	60 %	20 %	0 %	24212701
16	NC_004342	TCT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
17	NC_004342	ATGA	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	24212701
18	NC_004342	GAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212701
19	NC_004342	TC	3	6	872	877	0 %	50 %	0 %	50 %	24212701
20	NC_004342	A	6	6	889	894	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
21	NC_004342	T	6	6	906	911	0 %	100 %	0 %	0 %	24212701
22	NC_004342	GAAA	2	8	933	940	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
23	NC_004342	TCA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212701
24	NC_004342	AT	3	6	1114	1119	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
25	NC_004342	T	6	6	1124	1129	0 %	100 %	0 %	0 %	24212701
26	NC_004342	GAA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212701
27	NC_004342	CTT	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
28	NC_004342	ATTT	2	8	1182	1189	25 %	75 %	0 %	0 %	24212701
29	NC_004342	A	6	6	1194	1199	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
30	NC_004342	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
31	NC_004342	T	7	7	1213	1219	0 %	100 %	0 %	0 %	24212701
32	NC_004342	GAAA	2	8	1235	1242	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
33	NC_004342	A	6	6	1247	1252	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
34	NC_004342	A	8	8	1266	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
35	NC_004342	AATTT	2	10	1318	1327	40 %	60 %	0 %	0 %	24212701
36	NC_004342	AGAA	3	12	1356	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
37	NC_004342	AT	3	6	1384	1389	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
38	NC_004342	TTTA	2	8	1393	1400	25 %	75 %	0 %	0 %	24212701
39	NC_004342	AC	3	6	1457	1462	50 %	0 %	0 %	50 %	24212701
40	NC_004342	CTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
41	NC_004342	CAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212701
42	NC_004342	T	6	6	1523	1528	0 %	100 %	0 %	0 %	24212701
43	NC_004342	ATTC	2	8	1567	1574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004342	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004342	A	6	6	1697	1702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004342	TAA	2	6	1730	1735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004342	AGT	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004342	TCA	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004342	C	6	6	1928	1933	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_004342	TCA	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_004342	AGA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004342	CGA	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_004342	ATT	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004342	GGTT	2	8	2058	2065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004342	AGT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004342	T	9	9	2183	2191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004342	T	7	7	2231	2237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004342	AAG	2	6	2276	2281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004342	TATAA	2	10	2310	2319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004342	CAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004342	TGA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004342	TTTA	2	8	2384	2391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004342	ATG	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004342	AAT	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004342	TAAA	2	8	2533	2540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004342	TA	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004342	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004342	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004342	TAC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004342	GTT	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004342	AATT	2	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004342	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004342	ATT	2	6	2857	2862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004342	TA	3	6	2955	2960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004342	TAA	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004342	A	6	6	2991	2996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004342	AAAT	2	8	2999	3006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004342	ATT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004342	GAAAA	2	10	3074	3083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004342	A	8	8	3094	3101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004342	TAC	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004342	AAT	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004342	TTAA	2	8	3192	3199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004342	A	7	7	3214	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004342	TAC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212702
86	NC_004342	AG	3	6	3290	3295	50 %	0 %	50 %	0 %	24212702
87	NC_004342	TAT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
88	NC_004342	TC	3	6	3349	3354	0 %	50 %	0 %	50 %	24212702
89	NC_004342	TCAA	2	8	3374	3381	50 %	25 %	0 %	25 %	24212702
90	NC_004342	CTG	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212702
91	NC_004342	AAG	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
92	NC_004342	AAC	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212702
93	NC_004342	T	6	6	3449	3454	0 %	100 %	0 %	0 %	24212702
94	NC_004342	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
95	NC_004342	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
96	NC_004342	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212702
97	NC_004342	TTC	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
98	NC_004342	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
99	NC_004342	CTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
100	NC_004342	TTG	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212702
101	NC_004342	GAA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
102	NC_004342	CTTC	2	8	3791	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	24212702
103	NC_004342	TAT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
104	NC_004342	ACA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212702
105	NC_004342	TAT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
106	NC_004342	ATTG	2	8	3946	3953	25 %	50 %	25 %	0 %	24212702
107	NC_004342	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
108	NC_004342	AGA	2	6	4063	4068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
109	NC_004342	AATTTA	2	12	4106	4117	50 %	50 %	0 %	0 %	24212702
110	NC_004342	GAC	2	6	4235	4240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212702
111	NC_004342	ATTT	2	8	4309	4316	25 %	75 %	0 %	0 %	24212702
112	NC_004342	TAT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004342	TAT	2	6	4357	4362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004342	ATA	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004342	TTTAA	2	10	4423	4432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004342	TAT	2	6	4509	4514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004342	A	6	6	4567	4572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004342	TA	3	6	4602	4607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004342	A	7	7	4640	4646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004342	TTA	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004342	AGA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004342	T	6	6	4851	4856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004342	TA	3	6	4993	4998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004342	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
125	NC_004342	T	8	8	5080	5087	0 %	100 %	0 %	0 %	24212703
126	NC_004342	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
127	NC_004342	ATT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
128	NC_004342	AAAATT	2	12	5288	5299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212703
129	NC_004342	AAG	2	6	5305	5310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
130	NC_004342	A	8	8	5315	5322	100 %	0 %	0 %	0 %	24212703
131	NC_004342	TAT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
132	NC_004342	GGT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212703
133	NC_004342	CGG	2	6	5395	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212703
134	NC_004342	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
135	NC_004342	TTC	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212703
136	NC_004342	ATA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212703
137	NC_004342	A	7	7	5547	5553	100 %	0 %	0 %	0 %	24212703
138	NC_004342	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212703
139	NC_004342	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
140	NC_004342	GTT	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212703
141	NC_004342	GGA	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212703
142	NC_004342	GAT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212703
143	NC_004342	A	6	6	5833	5838	100 %	0 %	0 %	0 %	24212703
144	NC_004342	GGC	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212703
145	NC_004342	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
146	NC_004342	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212703
147	NC_004342	AGA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
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181	NC_004342	A	6	6	7550	7555	100 %	0 %	0 %	0 %	24212705
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272	NC_004342	A	6	6	11787	11792	100 %	0 %	0 %	0 %	24212707
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277	NC_004342	GGTTT	2	10	11874	11883	0 %	60 %	40 %	0 %	24212707
278	NC_004342	ATT	2	6	11948	11953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212707
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280	NC_004342	ACT	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212707
281	NC_004342	GTTTT	2	10	12046	12055	0 %	80 %	20 %	0 %	24212707
282	NC_004342	A	6	6	12157	12162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_004342	GGC	2	6	12196	12201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_004342	CGA	3	9	12218	12226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294827554
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400	NC_004342	ATC	2	6	17617	17622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212713
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403	NC_004342	TTAGA	2	10	17848	17857	40 %	40 %	20 %	0 %	24212713
404	NC_004342	AGAA	2	8	17873	17880	75 %	0 %	25 %	0 %	24212713
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406	NC_004342	TGAG	2	8	17956	17963	25 %	25 %	50 %	0 %	24212713
407	NC_004342	TTG	2	6	18024	18029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212713
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409	NC_004342	CGA	2	6	18278	18283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212713
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411	NC_004342	TAAAA	2	10	18315	18324	80 %	20 %	0 %	0 %	24212713
412	NC_004342	TTC	2	6	18331	18336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212714
413	NC_004342	A	7	7	18411	18417	100 %	0 %	0 %	0 %	24212714
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415	NC_004342	T	6	6	18427	18432	0 %	100 %	0 %	0 %	24212714
416	NC_004342	T	6	6	18452	18457	0 %	100 %	0 %	0 %	24212714
417	NC_004342	TTC	2	6	18499	18504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212714
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421	NC_004342	A	7	7	18582	18588	100 %	0 %	0 %	0 %	24212714
422	NC_004342	T	6	6	18619	18624	0 %	100 %	0 %	0 %	24212714
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424	NC_004342	A	6	6	18662	18667	100 %	0 %	0 %	0 %	24212714
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434	NC_004342	TGA	2	6	19086	19091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212714
435	NC_004342	AAT	2	6	19094	19099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212714
436	NC_004342	GCT	2	6	19259	19264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212714
437	NC_004342	TTTAGT	2	12	19330	19341	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	24212714
438	NC_004342	T	6	6	19352	19357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_004342	A	7	7	19401	19407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_004342	GTT	2	6	19433	19438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_004342	ATTTA	2	10	19462	19471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_004342	T	6	6	19568	19573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_004342	TTA	2	6	19784	19789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_004342	TAAA	2	8	19846	19853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_004342	T	7	7	19866	19872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_004342	ATAAA	2	10	19891	19900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_004342	A	6	6	20173	20178	100 %	0 %	0 %	0 %	24212717
456	NC_004342	AT	3	6	20199	20204	50 %	50 %	0 %	0 %	24212717
457	NC_004342	T	6	6	20299	20304	0 %	100 %	0 %	0 %	24212717
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463	NC_004342	GATTC	2	10	20612	20621	20 %	40 %	20 %	20 %	24212717
464	NC_004342	GCCTT	2	10	20709	20718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
465	NC_004342	AT	4	8	20787	20794	50 %	50 %	0 %	0 %	294827557
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474	NC_004342	ATATT	2	10	21237	21246	40 %	60 %	0 %	0 %	294827557
475	NC_004342	TAT	2	6	21313	21318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294827557
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496	NC_004342	T	6	6	21840	21845	0 %	100 %	0 %	0 %	24212719
497	NC_004342	CTT	2	6	21863	21868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212719
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500	NC_004342	T	6	6	21935	21940	0 %	100 %	0 %	0 %	24212719

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